Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms