Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ATG4DQ86TL0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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