Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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