Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBP07199 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBP07199 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms