Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LRRTM2O43300 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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