Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNN4O15554 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNN4O15554 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNN4O15554 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms