Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms