Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms