Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LHX3Q9UBR4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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