Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCO2Q9BYV7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms