Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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