Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPS3Q969F9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms