Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRIP1Q5VSL9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms