Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MTFR1L-201ENST00000374300 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms