Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms