Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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