Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms