Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms