Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXQ1Q9C009 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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