Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms