Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNTB2Q13425 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms