Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRG1Q02297 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NRG1Q02297 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms