Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CDK16Q00536 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDK16Q00536 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDK16Q00536 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK16Q00536 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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