Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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