Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms