Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF479Q96JC4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF479Q96JC4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF479Q96JC4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF479Q96JC4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF479Q96JC4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF479Q96JC4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms