Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms