Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms