Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms