Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms