Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD1BQ9P298 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms