Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3CQ92520 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms