Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.7 ms