Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRMPD4Q14CM0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMPD4Q14CM0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms