Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TSPOP30536 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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