Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms