Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCINQ9Y6U3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCINQ9Y6U3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCINQ9Y6U3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms