Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNRGQ9UMZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNRGQ9UMZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms