Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC24A2Q9UI40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms