Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC3IPQ9P2W1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms