Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf78Q9NZ63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf78Q9NZ63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf78Q9NZ63 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms