Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms