Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF3Q9NR81 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms