Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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