Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FUNDC2Q9BWH2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FUNDC2Q9BWH2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms