Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM109Q9BVC6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms