Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms