Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BEST4Q8NFU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BEST4Q8NFU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms