Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNYL1Q8N7R7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL1Q8N7R7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms