Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC13Q8IYE1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms